山东省疼痛医学会原名山东省疼痛研究会，创建于1990年11月8日，创建时挂靠于山东医科大学，财务管理由山东医科大学托管。个人会员100余人。
学会第一任(第一届1990~1994，第二届1994~1999)理事长为李大年教授(山东大学齐鲁医院神经内科创始人之一)，秘书长张敏教授。
山东大学齐鲁医院神经内科主任，创始人之一，硕士生导师李大年教授
第二任(第三届1999~2003，第四届2003~2008)理事长为张衡教授，第三届秘书长刘沂训教授，第四届秘书长刘德山教授。
原山东医学科大学副校长、博士生导师张衡教授
第三任(第五届2008~2013，第六届2013~2017)理事长为吴承远教授(曾受到江泽民、胡锦涛总书记在中南海接见)，秘书长刘玉光教授。学会挂靠山东大学齐鲁医院，财务由山东大学齐鲁医院托管。
山东大学齐鲁医院神经外科原主任、博士生导师吴承远教授
第四任(第七届2017~2022，第八届2022~)理事长为刘玉光教授(全国优秀科技工作者、山东省政协常委)，秘书长李峰教授(2017~2020)及孙聪颖(2020~)，孙聪颖为现任专职秘书长。
山东大学齐鲁医院外科中心副主任、博士生导师刘玉光教授
2011年经山东省科协组织委员会批准成立了学会党支部。第一届党支部书记由理事长吴承远教授兼任，第二届党支部书记是宋广德教授(山东省职业病医院原党委书记)。
2015年，作为发起单位之一，成为山东省社会组织联合会常务副会长单位。
2017年，学会更名为山东省疼痛医学会，转型为综合医学类学会，设立秘书处，由6个部门组成，财务脱离挂靠单位。
2017年，学会签约全国优秀律师作为学会法律顾问，指导学会依法办会。
2020年学会全面实现秘书处实体化，秘书长专职化、职业化。同年，复刊《山东省疼痛医学会》会刊。
2022年，学会被民政厅评为山东省5A级社会组织，选树为首批百家“山东省社会组织标杆”。
2017~2023年期间，先后颁布实施了65条规章制度，使学会走向了法制化、规范化、制度化、学术化办会的道路。截止到2023年6月，个人会员达到20000余人。
